在上一季中，以果敢干练的作风和高超惊人的医术，人称 “Doctor X”外科医生大门未知子（米仓凉子 饰）在早已形同腐臭泥潭一般的帝都医科大学第三医院力挽狂澜，掀起前所未有的风暴。因在北海道马场冒险为一匹骨折的马做手术，未知子得到内科专家马渊一代（三田佳子 饰）的赏识，进而受邀踏入全日本顶尖医者云集的殿堂——帝都医科大学附属医院！此前不久，外科总负责人蛭间重盛（西田敏行 饰）曾亲手为医院的大金主——某地产大鳄二宫钦也（寺田农 饰）完成高危手术，谁知此番二宫癌症复发再度入院。第二外科主任海老名（远藤宪一 饰）携团队积极备战，配合蛭间迎接新一轮的手术。而马渊所率领的内科则就治疗方式上与外科产生严重分歧和对立。未知子的到来，无疑使双方的矛盾趋于白热化……

该剧是《Doctor-X~外科医·大门未知子~》第五部，讲述了自由外科医生大门未知子无视黑暗的医疗制度与医院中的权力之争，一心一意挽救患者生命的故事。

受医疗制度改革的影响，曾经显赫一时的大学医院——帝都医科大学第三医院因医疗状况恶化和工作压力过大导致卓越出众的医师纷纷离职，人才流失造成医院的发展岌岌可危。在此背景之下，不属于大学医院和医局体制的自由医生应运而生。美丽性感的外科医生大门未知子（米仓凉子 饰）便是自由医生的一员，她被人称作“Doctor X”，讨厌拉帮结派和医疗腐败，有如一朵盛开在泥沼中的带刺野玫瑰。未知子的到来给了这间迂腐凝滞的一前所未有的冲击，而她过硬的外科技术和理论知识又令同侪钦佩与嫉妒。战战兢兢的新人森本光（田中圭 饰）负责带领这名曾涉足海外的传奇人物。未知子将迎战各种疑难杂症以及无形的阻碍……

东帝大学医院本是国内大学医院中的泰山北斗，近年来却落入了不可告人的行为、医疗失误和派系斗争的泥潭中，评价一落千丈。而夺取新院长之位将强大权力据为己有，计划重新建立医院品牌形象的，不是别人，正是多年来对大门未知子（米仓凉子饰）怀恨在心的野心家蛭间重胜（西田敏行饰）。以“拯救眼前的生命”为己任的未知子被东帝大学医院雇用，深入蛭间重胜执掌的“敌阵”之中。她将面对的是有史以来最危险、最强大的敌人副院长久保东子（泉品子饰）

2019年，日本迎来了令和时代，而医疗界陷入大混乱——权威世代与次世代的竞争、与电脑、AI的共存等诸多问题乘着时代的波涛扑天盖地而来。就在这时，东帝大学医院出现了前所未有的赤字。外号“秃鹰”的投资家尼古拉斯·丹下来处在破产边缘的“白色巨塔”。根据全世界屈指可数的企业再生专家丹下提出的再生计划，东帝大学医院走上了经营重建的道路。但是，另一方面，迫于“医疗合理化”的压力，医院也面临着裁员和削减成本的现实，本是拯救生命的医疗前战，却变成了“生意优先”，越发成为政治与权力争夺的战场。这时，大门未知子被丹下叫回东帝大学医院。在新的权力争夺白势化的“白色巨塔”，她展开了孤高的挑战。

第七季以百年一度的大流行病导致世界各地的医疗崩溃为舞台，新局面迎来是日本最高峰的教学医院—东帝大学医院，把感染治疗和内科作为重中之重，并计划推迟不必要的紧急手术。曾经知名的外科被移往分院的大楼，内科医生推广不使用手术刀的化学手术，显示出兴起的迹象。被感染危机和东帝大新权力席卷的未知子，在如同战场般疲惫的医疗现场也毫不退缩地走上了自己的道路。

2014年，白色巨塔的崩溃没有停歇，新的医疗政策反而将医学界推入更加弱肉强食的世界。集合了业内顶尖精英的国立高度医疗化中心建立，只不过这里却成为东西两派争权夺利的死战场。西京大学的谈合坂升（伊武雅刀 饰）在院长蛭间重盛（西田敏行 饰）的授意下向东大的海老名（远藤宪一 饰）一方发起猛攻。而就在此时，病情极度复杂的毒岛隆之介（伊东四朗 饰）被送入医疗中心。当所有人束手无策之际，法外医生大门未知子（米仓凉子 饰）及时出现，力挽狂澜，令所有人刮目相看。中心理事天堂义人（北大路欣也 饰）借此机会夺得总长职务，并高薪将大门纳入麾下。绝不依权附势的未知子，此番将迎接更大的挑战……